Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mbd2Q9Z2E1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd2Q9Z2E1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd2Q9Z2E1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd2Q9Z2E1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd2Q9Z2E1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd2Q9Z2E1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd2Q9Z2E1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd2Q9Z2E1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms