Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn8Q9Z260 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn8Q9Z260 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn8Q9Z260 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1513.8 ms