Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W6

TDRKH, Tudor and KH domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKHQ9Y2W6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRKHQ9Y2W6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRKHQ9Y2W6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRKHQ9Y2W6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRKHQ9Y2W6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRKHQ9Y2W6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRKHQ9Y2W6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRKHQ9Y2W6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRKHQ9Y2W6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms