Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VapaQ9WV55 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapaQ9WV55 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VapaQ9WV55 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms