Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3glb1Q9JK48 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3glb1Q9JK48 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3glb1Q9JK48 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 283 ms