Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm7Q9ESD6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm7Q9ESD6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms