Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl4Q9DCU6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl4Q9DCU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms