Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snrnp35Q9D384 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snrnp35Q9D384 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms