Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
INPP4AQ96PE3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
INPP4AQ96PE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INPP4AQ96PE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms