Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh10Q8VCH7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh10Q8VCH7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh10Q8VCH7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh10Q8VCH7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh10Q8VCH7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh10Q8VCH7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh10Q8VCH7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh10Q8VCH7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh10Q8VCH7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdh10Q8VCH7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdh10Q8VCH7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rdh10Q8VCH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms