Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmc2Q8K199 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmc2Q8K199 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmc2Q8K199 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmc2Q8K199 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmc2Q8K199 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmc2Q8K199 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmc2Q8K199 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms