Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atad2Q8CDM1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atad2Q8CDM1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atad2Q8CDM1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.6 ms