Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Csgalnact2Q8C1F4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csgalnact2Q8C1F4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csgalnact2Q8C1F4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms