Protein–RNA interactions for Protein: Q8C116

Fmo9, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo9Q8C116 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fmo9Q8C116 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fmo9Q8C116 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fmo9Q8C116 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms