Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef5Q8C0Q9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef5Q8C0Q9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rapgef5Q8C0Q9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef5Q8C0Q9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rapgef5Q8C0Q9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rapgef5Q8C0Q9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rapgef5Q8C0Q9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef5Q8C0Q9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef5Q8C0Q9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.4 ms