Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4bQ8BGE6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4bQ8BGE6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg4bQ8BGE6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 496.2 ms