Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGB5

Limd2, LIM domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd2Q8BGB5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Limd2Q8BGB5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Limd2Q8BGB5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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