Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim19Q80ZU4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim19Q80ZU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim19Q80ZU4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim19Q80ZU4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim19Q80ZU4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim19Q80ZU4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim19Q80ZU4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim19Q80ZU4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim19Q80ZU4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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