Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LnpkQ7TQ95 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LnpkQ7TQ95 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LnpkQ7TQ95 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LnpkQ7TQ95 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LnpkQ7TQ95 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LnpkQ7TQ95 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LnpkQ7TQ95 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms