Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg5Q6ZPY2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg5Q6ZPY2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg5Q6ZPY2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms