Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga3Q62470 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga3Q62470 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms