Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sin3bQ62141 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3bQ62141 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms