Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dsg1aQ61495 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms