Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sin3aQ60520 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Sin3aQ60520 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sin3aQ60520 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 340.1 ms