Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF394Q53GI3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF394Q53GI3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF394Q53GI3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms