Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDF6

Cfhr2, Complement factor H-related 2, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfhr2Q4LDF6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfhr2Q4LDF6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfhr2Q4LDF6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfhr2Q4LDF6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfhr2Q4LDF6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfhr2Q4LDF6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms