Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA4Q14CN2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA4Q14CN2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA4Q14CN2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA4Q14CN2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA4Q14CN2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCA4Q14CN2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA4Q14CN2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms