Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.16□□□□□ -1.74
CCW12Q12127 SSZ1YHR064C 1617 nt4.16□□□□□ -1.74
CCW12Q12127 MPA43YNL249C 1629 nt4.16□□□□□ -1.74
CCW12Q12127 RFA1YAR007C 1866 nt4.15□□□□□ -1.74
CCW12Q12127 YDL144CYDL144C 1071 nt4.15□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YDR053WYDR053W 396 nt4.15□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 IDP3YNL009W 1263 nt4.15□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 MTQ1YNL063W 945 nt4.15□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YNR048WYNR048W 1182 nt4.15□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 UBC4YBR082C 447 nt4.15□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 MKK1YOR231W 1527 nt4.15□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 LSG1YGL099W 1923 nt4.15□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 GEP3YOR205C 1671 nt4.14□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 COX26YDR119W-A 201 nt4.14□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 NQM1YGR043C 1002 nt4.14□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.14□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YLL059CYLL059C 507 nt4.14□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 HXT3YDR345C 1704 nt4.14□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 HRP1YOL123W 1605 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 DED81YHR019C 1665 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YAP1801YHR161C 1914 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 GPT2YKR067W 2232 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 CBP4YGR174C 513 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 SCW4YGR279C 1161 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YIL077CYIL077C 963 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YPL102CYPL102C 303 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 ACF2YLR144C 2340 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 BUD9YGR041W 1644 nt4.13□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 IME2YJL106W 1938 nt4.12□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 VPS70YJR126C 2436 nt4.12□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 BRF1YGR246C 1791 nt4.12□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 ALT1YLR089C 1779 nt4.12□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 RPT1YKL145W 1404 nt4.12□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 HFI1YPL254W 1467 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YDL034WYDL034W 345 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YHC3YJL059W 1227 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 SEN34YAR008W 828 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 LST8YNL006W 912 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YBL070CYBL070C 321 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 MRPL22YNL177C 930 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 GPM3YOL056W 912 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 ARR3YPR201W 1215 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 PIF1YML061C 2580 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 RET1YOR207C 3450 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 SGV1YPR161C 1974 nt4.11□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YHR045WYHR045W 1683 nt4.1□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 GIR2YDR152W 798 nt4.1□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 CWC21YDR482C 408 nt4.1□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YGR022CYGR022C 330 nt4.1□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.1□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 MRPL36YBR122C 534 nt4.1□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 NUD1YOR373W 2556 nt4.1□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 PDC1YLR044C 1692 nt4.1□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 MNN2YBR015C 1794 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 TAX4YJL083W 1815 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 CAD1YDR423C 1230 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 MND2YIR025W 1107 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 TFS1YLR178C 660 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 RPS19BYNL302C 435 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 LEM3YNL323W 1245 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YOR300WYOR300W 309 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt4.09□□□□□ -1.75
CCW12Q12127 YEL077CYEL077C 3834 nt4.09□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 YDL119CYDL119C 924 nt4.08□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 GCS1YDL226C 1059 nt4.08□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 DPH2YKL191W 1605 nt4.08□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 YLR296WYLR296W 327 nt4.08□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 YMR027WYMR027W 1413 nt4.08□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 SIA1YOR137C 1869 nt4.08□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 RPT4YOR259C 1314 nt4.08□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 ULA1YPL003W 1389 nt4.08□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.08□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 KIP2YPL155C 2121 nt4.07□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 QDR1YIL120W 1692 nt4.07□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 QRI1YDL103C 1434 nt4.07□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 PPR1YLR014C 2715 nt4.07□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 ERI1YPL096C-A 207 nt4.07□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 VTC2YFL004W 2487 nt4.07□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 GFA1YKL104C 2154 nt4.07□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 NOT3YIL038C 2511 nt4.06□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 GDB1YPR184W 4611 nt4.06□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 MRF1YGL143C 1242 nt4.06□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 FZF1YGL254W 900 nt4.06□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 SPG1YGR236C 288 nt4.06□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 EGD2YHR193C 525 nt4.06□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 MTW1YAL034W-A 870 nt4.06□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 MRP17YKL003C 396 nt4.06□□□□□ -1.76
CCW12Q12127 COS9YKL219W 1224 nt4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.5 ms