Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms