Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 PSH1YOL054W 1221 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 ATP4YPL078C 735 nt5.46□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 VCX1YDL128W 1236 nt5.45□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 HCR1YLR192C 798 nt5.45□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 GEX1YCL073C 1848 nt5.45□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 GEX2YKR106W 1848 nt5.45□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 VTH1YIL173W 4650 nt5.45□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 VTH2YJL222W 4650 nt5.45□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 EHD3YDR036C 1503 nt5.44□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 RHB1YCR027C 630 nt5.44□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 SHE10YGL228W 1734 nt5.44□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.44□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 RPS15YOL040C 429 nt5.43□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 YPR098CYPR098C 486 nt5.43□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 MRPL36YBR122C 534 nt5.43□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 CLP1YOR250C 1338 nt5.43□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 RFA1YAR007C 1866 nt5.43□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 ATF1YOR377W 1578 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 BRL1YHR036W 1416 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 YDL034WYDL034W 345 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 HEM3YDL205C 984 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 CWC21YDR482C 408 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 YIL060WYIL060W 435 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 YIL077CYIL077C 963 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 PGA3YML125C 939 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 YEL020CYEL020C 1683 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 TRK2YKR050W 2670 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 LSG1YGL099W 1923 nt5.42□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 SEC12YNR026C 1416 nt5.41□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 NSE5YML023C 1671 nt5.41□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 PIF1YML061C 2580 nt5.41□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.41□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 HOR7YMR251W-A 180 nt5.41□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 UGO1YDR470C 1509 nt5.41□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 JIP4YDR475C 2631 nt5.4□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 ADY2YCR010C 852 nt5.4□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 EFM4YIL064W 774 nt5.4□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 COS9YKL219W 1224 nt5.4□□□□□ -1.54
TRM12Q04235 HSP104YLL026W 2727 nt5.4□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 DUG1YFR044C 1446 nt5.4□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 ACF2YLR144C 2340 nt5.39□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 COX26YDR119W-A 201 nt5.39□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 YNR048WYNR048W 1182 nt5.39□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 GPT2YKR067W 2232 nt5.39□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 PCS60YBR222C 1632 nt5.38□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 YDR053WYDR053W 396 nt5.38□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 GIR2YDR152W 798 nt5.38□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 PGA2YNL149C 390 nt5.38□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 BAP2YBR068C 1830 nt5.38□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 SUB2YDL084W 1341 nt5.38□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 PDH1YPR002W 1551 nt5.38□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 UTP7YER082C 1665 nt5.37□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.37□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 PIN2YOR104W 849 nt5.37□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 HPF1YOL155C 2904 nt5.37□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 CAD1YDR423C 1230 nt5.36□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 YLR194CYLR194C 765 nt5.36□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 MTQ1YNL063W 945 nt5.36□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 ARG1YOL058W 1263 nt5.36□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 RPT1YKL145W 1404 nt5.36□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 SCT1YBL011W 2280 nt5.36□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 LDB19YOR322C 2457 nt5.36□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 YAP1801YHR161C 1914 nt5.35□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 TEF1YPR080W 1377 nt5.35□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 TEF2YBR118W 1377 nt5.35□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 ACC1YNR016C 6702 nt5.35□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 IDP3YNL009W 1263 nt5.35□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 VTC2YFL004W 2487 nt5.35□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 PDC1YLR044C 1692 nt5.34□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 MSS1YMR023C 1581 nt5.34□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 NUD1YOR373W 2556 nt5.34□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 YEL077CYEL077C 3834 nt5.34□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 YGR176WYGR176W 348 nt5.34□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.34□□□□□ -1.55
TRM12Q04235 EMW1YNL313C 2715 nt5.33□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 YBL044WYBL044W 369 nt5.33□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 DAL82YNL314W 768 nt5.33□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 UTP18YJL069C 1785 nt5.33□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 YHR045WYHR045W 1683 nt5.33□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 HXT3YDR345C 1704 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 DED81YHR019C 1665 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 SYN8YAL014C 768 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 PGU1YJR153W 1086 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 YLL059CYLL059C 507 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 UBC4YBR082C 447 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 HFI1YPL254W 1467 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 DBP9YLR276C 1785 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 IMA2YOL157C 1770 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 MNN2YBR015C 1794 nt5.32□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 RTT106YNL206C 1368 nt5.31□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 ARP2YDL029W 1176 nt5.31□□□□□ -1.56
TRM12Q04235 MTQ2YDR140W 666 nt5.31□□□□□ -1.56
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