Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mmp11Q02853 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp11Q02853 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms