Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vamp7P70280 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vamp7P70280 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vamp7P70280 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms