Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acta1P68134 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Acta1P68134 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta1P68134 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta1P68134 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Acta1P68134 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Acta1P68134 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Acta1P68134 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms