Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aqp4P55088 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aqp4P55088 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aqp4P55088 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Aqp4P55088 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aqp4P55088 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Aqp4P55088 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aqp4P55088 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aqp4P55088 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms