Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GemP55041 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GemP55041 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GemP55041 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GemP55041 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GemP55041 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GemP55041 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GemP55041 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GemP55041 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GemP55041 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GemP55041 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GemP55041 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GemP55041 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GemP55041 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GemP55041 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GemP55041 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GemP55041 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GemP55041 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GemP55041 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GemP55041 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GemP55041 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GemP55041 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GemP55041 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GemP55041 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GemP55041 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GemP55041 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GemP55041 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GemP55041 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GemP55041 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GemP55041 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GemP55041 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GemP55041 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GemP55041 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GemP55041 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GemP55041 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GemP55041 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GemP55041 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GemP55041 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GemP55041 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GemP55041 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GemP55041 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GemP55041 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GemP55041 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GemP55041 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GemP55041 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GemP55041 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GemP55041 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GemP55041 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GemP55041 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GemP55041 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GemP55041 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GemP55041 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GemP55041 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GemP55041 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GemP55041 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GemP55041 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GemP55041 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GemP55041 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GemP55041 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GemP55041 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GemP55041 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GemP55041 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GemP55041 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GemP55041 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GemP55041 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GemP55041 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GemP55041 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GemP55041 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GemP55041 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GemP55041 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GemP55041 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GemP55041 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GemP55041 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GemP55041 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GemP55041 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GemP55041 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GemP55041 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GemP55041 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GemP55041 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GemP55041 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GemP55041 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GemP55041 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GemP55041 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GemP55041 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GemP55041 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GemP55041 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GemP55041 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GemP55041 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GemP55041 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms