Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpdP50404 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpdP50404 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpdP50404 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpdP50404 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpdP50404 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SftpdP50404 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SftpdP50404 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpdP50404 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpdP50404 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms