Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd22P35329 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd22P35329 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd22P35329 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd22P35329 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd22P35329 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd22P35329 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd22P35329 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd22P35329 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cd22P35329 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd22P35329 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd22P35329 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd22P35329 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd22P35329 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms