Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RxrbP28704 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrbP28704 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrbP28704 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrbP28704 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrbP28704 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxrbP28704 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxrbP28704 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrbP28704 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RxrbP28704 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RxrbP28704 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RxrbP28704 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RxrbP28704 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RxrbP28704 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RxrbP28704 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.8 ms