Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13aP19253 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13aP19253 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms