Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calb1P12658 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb1P12658 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb1P12658 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Calb1P12658 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Calb1P12658 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms