Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax1P09084 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax1P09084 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax1P09084 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pax1P09084 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax1P09084 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax1P09084 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax1P09084 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax1P09084 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms