Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX11BO96011 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEX11BO96011 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms