Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CopeO89079 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CopeO89079 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CopeO89079 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CopeO89079 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CopeO89079 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CopeO89079 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CopeO89079 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CopeO89079 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CopeO89079 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopeO89079 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopeO89079 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopeO89079 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopeO89079 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopeO89079 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopeO89079 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopeO89079 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopeO89079 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CopeO89079 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopeO89079 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopeO89079 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopeO89079 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopeO89079 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CopeO89079 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CopeO89079 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CopeO89079 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CopeO89079 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CopeO89079 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopeO89079 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CopeO89079 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CopeO89079 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CopeO89079 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CopeO89079 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CopeO89079 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CopeO89079 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopeO89079 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopeO89079 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopeO89079 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopeO89079 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopeO89079 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopeO89079 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopeO89079 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopeO89079 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopeO89079 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopeO89079 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopeO89079 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopeO89079 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopeO89079 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopeO89079 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopeO89079 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopeO89079 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopeO89079 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopeO89079 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopeO89079 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopeO89079 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopeO89079 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms