Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn6O35646 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn6O35646 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn6O35646 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn6O35646 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn6O35646 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn6O35646 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn6O35646 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn6O35646 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn6O35646 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn6O35646 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn6O35646 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn6O35646 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn6O35646 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms