Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc16a8O35308 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc16a8O35308 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms