Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf11aO35305 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf11aO35305 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf11aO35305 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms