Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn9O35239 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Ptpn9O35239 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Ptpn9O35239 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn9O35239 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms