Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QKU1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QKU1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QKU1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QKU1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
J3QKU1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
J3QKU1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
J3QKU1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QKU1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QKU1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QKU1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QKU1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QKU1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QKU1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QKU1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QKU1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QKU1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QKU1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QKU1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QKU1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QKU1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QKU1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QKU1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QKU1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QKU1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QKU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QKU1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QKU1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QKU1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QKU1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QKU1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QKU1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QKU1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QKU1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QKU1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QKU1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QKU1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QKU1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QKU1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QKU1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QKU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QKU1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QKU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QKU1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
J3QKU1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QKU1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QKU1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QKU1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QKU1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QKU1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QKU1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QKU1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QKU1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QKU1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QKU1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QKU1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QKU1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QKU1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QKU1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QKU1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QKU1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QKU1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QKU1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QKU1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QKU1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QKU1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QKU1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QKU1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QKU1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QKU1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QKU1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QKU1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QKU1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QKU1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QKU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
J3QKU1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QKU1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms