Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29094F6Q785 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm29094F6Q785 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms