Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1500009C09RikD3YYW9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1500009C09RikD3YYW9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1500009C09RikD3YYW9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms